Die Abteilung Identifikation und Sicherheitsprüfung (AIS) ist verantwortlich für die Identifizierung und Sicherheitsprüfung von ausländischen Personen im Asyl- und Ausländerbereich. AIS unterstützt verschiedene Abteilungen im SEM, andere Bundesämter, kantonale Stellen sowie ausländische Behörden bei der Identitätsabklärung von ausländischen Personen. Sie dient damit verschiedenen Verfahren wie namentlich die Aufenthalts- und Niederlassungsbewilligungen, die Einbürgerungen sowie Asyl- und Rückkehrentscheide. Die Sektion Identifikation und Sicherheitsprüfung Grundlagen erledigt zugunsten des SEM strategische Aufgaben im Bereich der Biometrie und Sicherheit. Überdies führt sie Projekte im Rahmen der Schengen-entwicklungen wie Interoperabilität und Eurodac. Schliesslich setzt sie nationale Gesetzgebungsaufträge um, wie die Auswertung von Mobiltelefonen von Asylsuchenden zu deren Identifizierung (Projekt 'ADAM').